Lo shuttle collega l’aeroporto alla stazione centrale di Pisa, con fermata intermedia ai parcheggi
La Stazione FS / Pisa Centro è situata in corrispondenza del binario numero 14. Dall’esterno l’accesso avviene direttamente da via Quarantola, nel quartiere di San Giusto.
La Stazione San Giusto/Aurelia è la fermata intermedia. Accessibile da Via di Goletta e dalla nuova rotatoria in corrispondenza della Via Aurelia, dispone di due grandi parcheggi scambiatori e si trova anche la Biglietteria Aziendale.
La Stazione Aeroporto è situata di fronte all’edificio servizi portuali sul limite della zona destinata al City-Gate.